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https://www.dropbox.com/home/procariontes/pdf%20lecturas%20obligatorias

Temario

BIOLOGÍA DE PROCARIONTES

grupo 5013 martes y jueves 1-2.30PM

Semestre 2014-1

Profesora Teoría           Valeria Souza, souza.valeria2@gmail.com

Profesora Laboratorio     Katya Guadarrama, katyadafne@gmail.com

             blog souzaprocariontes para postear sus ensayos de lecturas, que estan en el dropbox:

 https://www.dropbox.com/home/procariontes/pdf%20lecturas%20obligatorias

Clave: 1100                                        Modalidad: Asignatura fundamental.

Créditos: 10                                     

Horas por clase de teoría: 3               Horas Teórico-prácticas: 3

Horas por semestre teóricas: 48        Horas teórico-prácticas por semestres: 48

EVALUACIÓN

Calificación final:

50% Teoría

50% Laboratorio

Calificación de Teoría:

40% Exámenes a casa (2)

50% Tareas en equipo, Ensayos 2 cada 15 dias obligatorios a partir de una colección de ártículos sugeridos recientes. Los ensayos se subiran a un blog comun del grupo y estarán abiertos para todo el grupo. La mayoria es material que viene en la revista microbe de la ASM (American Association of Microbiology), las lecturas son en ingles, ni modo.

10% Exposiciones las bacterias y el hombre

TEMARIO

Semana del 5 al 10, Valeria estará fuera del pais, tomen tiempo para organizarse y leer primera lectura.

I. INTRODUCCIÓN 

Microbiología moderna, que estudia y como lo estudia.

Cuatro Cienegas coahuila, un caso de estudio.

13 agosto

entrega: lectura 1. de “pastel de lodo” por valeria souza..en papel, ya que necesito su mail para compartir las entradas en el blog.

II. ORÍGEN DE LA VIDA Y EL ORIGEN DE LA DIVERSIDAD

15 y 20 de agosto.

II.1 La escala de tiempo: origen del universo, origen de la vida

II.2. Condiciones de la Tierra primitiva.

II.3. Archeano y los tapetes microbianos

II.4 La primera bola de hielo, el P y el hierro bandeado

II.5 Proteozoico un mundo de estromatolitos

II.6 Origen de los Eucariontes

II.7 Segunda bola de nieve y como cambio el mar

II.8 La explosión del Cámbrico le abre camino a los organimos grandes….y a sus parasitos y comensales…

20 de agosto entrega de lecturas .

2. John C. Priscu and Kevin P. Hand, 2012,Microbial Habitability of Icy Worlds

3: N. Lake, 2012Life: is it inevitable or just a fluke?

III. METABOLISMO: Comida

           

III.1 ATP

III.2 Membranas, reacciones redox  22 agosto

            III.3 Diversidad metabólica y la historia del erase una vez 27, 29 de agosto

Fermentación

Respiración anaerobia

Metanogénesis

Quimiolitotrofía

Fotosíntesis anoxigénica

Entrega de lecturas 27 de agosto

4. Jia V. Li and Julian R. Marchesi, 2012Gut Microbe-Host Metabolic Interactions in Health and Disease.

5. Natalie Kuldell 2012 Living Machines: Some Assembly Required

Respiración aerobia

Fotosíntesis oxigénica

Entrega de lecturas 3 de septiembre

6. Sallie W. Chisholm, 2011, Unveiling Prochlorococcus

7. Michael J. McInerney, Jessica R. Sieber, and Robert P. Gunsalus, 2012 Microbial Syntrophy: Ecosystem-Level Biochemical Cooperation

IV. SISTEMÁTICA Y BIODIVERSIDAD

5 y 10 septiembre

IV.1. Sistemática y Clasificaciones

IV.2. Biodiversidad de procariontes

IV.2.1 Dominio Eubacteria

IV.2.2 Dominio Archaea

Entrega de lecturas 10 de septiembre

8. Jed A. Fuhrman, 2011, Oceans of Crenarchaeota: a Personal History Describing This Paradigm Shift

9. Eduardo A. Groisman, 2011, The Impact of Differential Regulation on Bacterial Speciation.

V. ECOLOGIA ¿quien se como que y cuando?

12, 17, 19 y 23 de septiembre

V 1. Papel de bacterias en el reciclaje de nutrientes

V 2. Biología Molecular y Metagenomica como herramienta de la ecología microbiana

V.3.Estilos de vida e interacciones con otros organismos

VI.3.1. Bacterias de vida libre.

VI.3.1 Parasitismo y Virus

VI.3.2 Mutualismo

VI.3.3 Otras interacciones

                        VI.3.4 Comunidades bacterianas

VI.3.5 Las bacterias como hospederos: bacteriófagos

VI.3.6 Depredadores de bacterias

entrega de lecturas 17 de septiembre

10. Andrew W. B. Johnston, Jonathan D. Todd, and Andrew R. J. Curson, 2012, Microbial Origins and Consequences of Dimethyl Sulfide

11. Jonathan P. Zehr, 2013, Interactions with Partners Are Key for Oceanic Nitrogen-Fixing Cyanobacteria

entrega de lecturas 24 septiembre

12. A. Dove, 1012. Microbiomics: The Germ Theory of Everything

13. Jack A. Gilbert and Folker Meyer, 2012, Modeling the Earth Microbiome.

24 septiembre Primer examen a casa entregar 10 de octubre junto con modelo de ADN

GENÉTICA y Sexualidad bacteriana

15 y 17 de octubre

            III.1. Genética bacteriana

                        III.1.1. Replicación

                        III.1.2. Transcripción

                        III.1.3. Traducción

                        III.1.4. Elementos genéticos móviles

                        III.1.5. Intercambio genético. Conjugación, transducción y
                        transformación

                        III.1.6. Consecuencias de la transferencia horizontal bacteriana

entrega de lectura 16 de octubre

14. Elio Schaechter, 2013,The Excitement of Clinical Microbiology

15. Kristen S. Swithers and Laura A. Katz, 2013, Reconstructing the Tree of Life

VI. MIGRACIÓN, ESPECIACIÓN Y EVOLUCIÓN

22, 24 y 29 de octubre

            VI 1. Migración: todo esta en todos lados????

VI. 2. Aislamiento receta escencia de la divesificación

VI. 3. Microevolución y el origen de las especies.

VI. 4. Radiaciones adaptativas en el Archaeano, que nos dice la genómica comparada.

Entrega de lecturas 24 de octubre

16. Dan I. Andersson and Joakim Näsvall, 2013, New Genes Arise via Innovation, Amplification, Divergence

17. Lindsey N. Wolf and Jeffrey E. Barrick, 2012, Tracking Winners and Losers in E. coli Evolution Experiments           

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VII. LAS BACTERIAS Y EL HOMBRE

31 octubre, 5 noviembre

VIII.1 Las bacterias en la industria

VIII.2 Producción de metabolitos

VIII.3 Producción de biomasa

VIII.4 Las bacterias en la agricultura

VIII.5 Las bacterias en la bioremediación

VIII.6 El control biológico de plagas

VIII.7.Las bacterias en la salud

Entrega de lecturas 31 octubre

18. Graham A. W. Rook, 2012, A Darwinian View of the Hygiene or “Old Friends” Hypothesis

19. Y Nguyen and Vanessa Sperandio, 2013, Signaling between Bacteria and Their Hosts

Examen a casa II, 14 noviembre entrega

Trabajos finales: presentaciones 21 y 26 noviembre

entrega trabajo final por equipo: 28 de noviembre.

Bibliografía:

Libros básicos:

Madigan, Martinko y Parker, 2000. Brock Biology of microorganisms. 9th edition. Prentice Hall, Inc. NJ. USA. (otras ediciones también sirven).

Staley, J.T., R.P. Gunsalus, S. Lory y J. Perry. (2007) Microbial Life. Sinauer Associates, Publishers.

Otros:

Lewin, 1998, Genes VIII.

B. Dixon, 1994, Power unseen, how microbes rules the world. W. H. Freeman, NY.

Nester, E., Anderson, D., Roberts, E., Nester, M. 2006. Microbiology a human perspective. McGraw-Hill Science. 811p

Pommerville, Jeffrey C. 2010. Alcamo's fundamentals of microbiology Sudbury, Massachusetts : Jones and Bartlett.

Wiley, J., Sherwood, L., Woolverton, C. (2009) Prescott/Harley/Klein´s Microbiology seven edition. McGraw-Hill Science. 1088p

Black, Jacquelyn G.(2008) Microbiology : Principles and explorations seven edition. Hoboken, New Jersey : J. Wiley, 422p.