domingo, 22 de septiembre de 2013

Microbial Syntrophy: Ecosystem-Level... - Tania Vargas

Microbial Syntrophy: Ecosystem-Level
Biochemical Cooperation
Michael J. McInerney, Jessica R. Sieber, and Robert P. Gunsalus
Volume 6, Number 11, 2011 / Microbe
Por Tania Lucero Vargas Luna

Gracias a las secuencias genómicas de Syntrophy se ha demostrado que estos microorganismos son esenciales para el ciclo global del carbono, que pueden producir hidrogeno, entre otras características.

El termino Syntrophy fue utilizado para describir el intercambio de los compuestos de azufre entre las bacterias fototróficas y las quimiótrofas, reductoras de azufre. Después el termino se utilizo para incluir al hidrógeno y formar intercambios en ambientes metanogenicos entre microbio fermentivo metabolizador y arqueas metanogenicas.

Se espera tener una mejor comprensión de los procesos microbianos y asi tener un mejor control de la degradación de los recursos para convertir los recursos renovables en energía
rica en metano.

En cuanto al ciclo del carbono, existen bacterias responsables de metabolizar petróleo y también polímeros naturales degradantes, como polisacáridos, proteínas, ácidos nucleídos y lípidos. Las bacterias hidrolizan los polímeros en sus hábitats anaerobias, luego fermentan los productos hidroliticos al acetato y acidos grasos de cadena larga, alcoholes y compuestos aromaticos. Entonces, el propinato, las cadenas largas de acidos grasos, y los mencionados anteriormente son Syntrophicalli metabolizado para formar hidrogeno y acetato. Por ultimo, están los dos grupos que usan hidrogeno y formiato que convierten el etilo, formiato e hidrogeno en dióxido de carbono y metano.

Syntrophy también juega un papel muy importante en la degradación de compuestos aromaticos, pues utiliza sus derivados de la CoA que luego degradan aun mas y forman sustratos metanogenicos.  

La posible interrupción del metabolismo de Syntrophy con los ácidos grasos puede retrasar la transformacion de la materia orgánica.

Una hipótesis señala que la actividad metanogenica y el metano pudo haber sido importante en eras anteriores, debido a que el planeta se calentó cuando podría haber ocurrido una glaseacion. Esto sufiere aumentos de metano en la atmosfera, lo que provoca calentamiento global.

Esta metanogénesis probablemente se acelerara a medida que los deshielos aumenten debido al incremento de temperaturas.

Una característica definitiva de Syntrophy es la transferencia de electrones en un proceso repiratorio especializado, pues requiere de energía para reducir termodinámicamente los procesos desfavorables de redox. Uno de estos procesos se llama codificación de electrones.
Los genes homólogos se encuentran en muchos anaerobios incluyendo metabolizadores microbianos. Los genes que codifican la hidrogenasa incluyen NADH deshidrogenasa y proteínas.

Los complejos de membrana pueden estar involucrados en la transferencia de electrones durante el metabolismo microbiano, por ejemplo S. wolfei y S. aciditrophicus (dos microorganismos similares) contienen menaquinonas que podrían funcionar como portador de electrones entre los complejos de membrana que participan en la oxidación del acetil CoA, los de hidrogenasas, deshidrogenasas u otro complejo de membrana redox.
Uno de estos genes predicho para codificar oxidorreductasa hierro-azufre en la membrana se encuentra en S. aciditrophicus y S. Wolfei. Este gen podría servir como módulo de entrada para los electrones de transferencia durante el metabolismo de acido aromático.
Durante el metabolismo microbiano, la rnf funcionaria en sentido inverso utilizando el gradiente de sodio para conducir la desfavorable reducción de ferredoxina con NADH


El problema aquí se encuentra en definir el estilo de vida de los microorganismos, pues no se sabe si no utilizan algunos genes en cultivos puros. También en saber como se comunican las células microbianas, una posibilidad puede ser la señalización de quórum, pero no se encuentran células gen dependientes de la densidad en sistemas de S. aciditrophicus o S. wolfei. Otra posibilidad incluye dos componentes de sistemas de regulación y de factores sigma.

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