domingo, 22 de septiembre de 2013

oceans of crenarchaeota : a personal history describing paradigm shift 

fabiola pantiga trejo

 Dividir en tres dominós la vida fue algo que propusieron  carl woese y sus colaboradores en : bacterias, eucarya, archaea, siendo este ultimo el nuevo nombre de arqueo bacterias  El cual los dividieron en dos reinos crenarchaeota, que se sabe que contiene termófilos extremos y el euryarchaeota que incluía a los metanógeos , halofilos extremos y algunos termófilos.
Esta idea de que los archeas son todos termófilos esta perpetuada todavía en los libros de biológica.

Un cambio que resonó  en los ecologías fue el de poder secuenciar al ADN de manera automatizada y el primer enfoque de esto , fue reportado en 1990 por steve giovannoni , que utilizo un método PCR para amplificar cianobacterias 16s RNA , encontrando inesperadamente un grupo llamado SAR11 diverso en  el mar cerca de la superficie.

Algo aun mas sorprendente que el grupo SAR11  en este nuevo enfoque analítico fue encontrar archea del grupo crenachaeota en mares del océano con ayuda del método PCR, esto fue inesperado por todo lo que se conocia con respecto a este grupo. y poco después encontró también una porción  rara  de menos del 2% de archaea del grupo II llamado eurayarchaeta cerca de la superficie del mar.

Esto obligo a utilizar otro método el cual fue ( fish ) , este detecto una porción pequeña de células arqueas cerca de la superficie, pero una mayor porción en aguas profundas.

la respuesta de su abundancia y su metabolismo se puede responder con todas las evidencias obtenidas , las cuales indican que su metabolismo es quimioautotrofica, esto significa que los organismos se alimentaban por la oxidación de amoniaco a nitrito, pero también hay evidencia de heterotrofia, la cuestión fundamental en todo esto es hasta que punto puede ser una mezcla de autotrofos  y heterotrofos. 

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