jueves, 19 de septiembre de 2013

8.- Océanos de Crenarchaeota: una historia personal que describe este cambio de paradigma




AILA AVILA JULIA TERESA
Océanos de Crenarchaeota: una historia personal que describe este cambio de paradigma
Jed A. Fuhrman.

Estudios de arqueas marinas durante las dos últimas décadas revelan la biología distintiva de estos microorganismos diversos y abundante”
Mediante la base ribosomal (ARN) sabemos que la vida se divide en tres líneas de descendencia aborigen. Tres dominios a los que denominamos bacteria, Eucarya y Archaea (Arqueobacteria). Así mismo cada una de estas tiene una jerarquía que se aplica a los tres dominios. Las arqueobacterias por su parte se dividen en los reinos Crenarchaeota, que inicialmente se sabe que contienen termófilos extremos (organismos que habitan en regiones donde las temperaturas son cercanas y muchas veces superiores a temperaturas de ebullición del agua), tales como las metanógenas, extremos halófilos, termófilos (Thermococcales), Pyrodictium y Thermoproteus y el Euryarchaeota. Y todo esto gracias a la aportación que se realizo en 1990 por Steve.G en Oregon, en el cual diseño un método de PCR con cebadores para amplificar 16S ARN de las cianobacterias.
En la búsqueda de la secuenciación ribosomal 16S en la superficie del oligotrófico subtropical- océano pacifico nororiental el hallazgo fue de una rica y gran biodiversidad, cinco de los siete clones que se tomaron al azar a una profundidad de 500m y 100m, donde la luz es accesible para la fabricación de la fotosíntesis, coincidían con las bacterias Crenarchaeota, sin embargo lo misterioso y confuso es que las muestras de agua que se extrajeron de ese lugar eran totalmente aerobias y en ese tiempo solo se conocían a las Crenarchaeotas como termófilas extremas y otras arqueas que son halófilos extremos, anaerobios estrictos, o termófilos.

Posteriormente descubrimientos más afondo acerca de estos extraordinarios organismo revelaron su abundancia en las profundidades de los océanos, incluso se informó del hallazgo de arqueas raras que en su totalidad representaban tan solo el 2% de la comunidad: crenarchaeal al que se le nombro grupo I y algunos Euryarchaeota, llamados Grupo II, no obstante estos en algunas ocasiones no eran detectables por la sonda de hibridación, lo cual propicio un nuevo enfoque analítico por hibridación (FISH), la metodología permitió  sugerir que las porciones anteriores de clon-hibridación no eran parciales después de todo en las archeas. Por lo tanto, los microorganismos que eran desconocidos hasta 1992 resultaron ser notablemente abundantes a nivel mundial.

¿Pero, que hace que estos organismos sean tan abundantes? Y ¿Qué tipo de metabolismo tienen?, la respuesta llegó a la conclusión de que en el residente Crenarchaeota crecían alrededor del 80% autotróficos y el 20% de heterotróficos, y que su relevancia mundial probablemente continuara sorprendiendo a la comunidad científica y que por lo tanto la síntesis de lípidos en las arqueas utilizan bicarbonato o dióxido de carbono como fuente, lo cual implica una autotrófica que da lugar a las heterotrofias.


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