domingo, 10 de noviembre de 2013

Reconstructin the Tree of Life - Tania Vargas

Reconstructing the Tree of Life
Kristen S. Swithers and Laura A. Katz
Microbe—Volume 8, Number 6, 2013
Por Tania Lucero Vargas Luna
El árbol de la vida es un esfuerzo por reconstruir  la evolución de los organismos. Sin embargo a lo largo de la historia estos arboles solo plantean el descenso vertical de los linajes, excluyendo a los híbridos y las transferencias genéticas laterales. Esta última ha aportado una gran evidencia sobre la importancia que tiene en la evolución, y genera información para proyectos como “El Árbol de la vida Abierta”, que pretende proporcionar un marco general para la comprensión de la biodiversidad terrestre.

Anteriormente se creía que la TGL se limitaba a las Archaeas y bacterias puesto que el genoma de las eucariotas se encuentra cubierto por envolturas nuclares que lo protegen. Sin embargo diversos análisis e investigaciones de transcriptoma han demostrado que la TGL juega un papel importante en la evolución de estas, al igual que en las bacterias y arqueas.

El detectar la TGL resulta un tanto difícil, pues existen muchísimos genes “extranjeros” en los genomas y tan solo tenemos que seleccionar genes que proporcionen ventajas selectivas y se mantengan constantes en las siguientes generaciones. El impacto que puede tener la TGL en el árbol de la vida seria muy grande puesto que  proporcionara una gama mas baja de eventos evolutivos.  La disponibilidad de información sobre los genomas secuenciados ofrece una oportunidad para determinar incongruencias en el árbol de la vida.
La TGL , en el caso de los linajes bacterianos y arqueas, depende de uno de varios mecanismos, como la transformación, transducción y conjugación. La transformación implica a una célula tomando ADN del ambiente. La transducción, la transferencia de material genético entre células a través de fagos o virus. Y la conjugación es la transferencia de genes, generalmente plásmidos, por un puente entre dos células.

Otra explicación de cómo un ADN extraño puede entrar en el genoma de las eucariotas es informalmente "Tú eres lo que comes" . Pues muchas eucariotas son fagotropicos, es decir, que subsisten gracias a otros microorganismos eucariotas  y bacterias. En otras palabras, los genes de los alimentos podrían ser incorporados al genoma del depredador a lo largo de la evolución.

Algunas eucariotas unicelulares recibieron una gran gama de transferencias de genes de bacterias, por ejemplo, los genes que recibióeron los parasitos  Balstocystis y les sirvieron para adaptarse a su nuevo entorno intestinal; los genes transferidos incluyen aquellas que codifican proteínas implicadas en el metabolismo energético, la ahesion, etc.

En el caso de los humanos existen muchos ejemplos, uno particular e interesante es que algunos japoneses pueden utilizar algas como fuente de cargono. Esto refleja una Transferencia de genes  producida entre bacteroides marinos y el intestino.

Normalmente los genes que permiten a algunos organismos adaptarse a las tripas de otros organismos provienen de las bacterias.


Existe un numero infinito de ejemplos donde la TGL juega un papel esencial para la supervivencia de los organismos y sin duda se tiene que tomar en cuenta para el diseño de la imagen del “árbol de la vida”, ya que se pretende capturar con precisión las lines verticales y laterales de la descendencia biológica.

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