A Darwinian View of the Hygiene or “Old Friends” Hypothesis

Graham A. W. Rook

Este artículo trata sobre la relación entre microorganismos y el huésped en el que se desarrolla, ya que estos dos sufren una coevolución y que de esta manera se vería afectada la inmunorregulación y la inhibición inmune inapropiada. De esta manera, durante años se observó había padecimientos que se desarrollaban en lugar con una mayor higiene y limpieza, que en otros países, por ejemplo, las alergias, hepatitis 1, enfermedades inflamatorias del intestino, etc.

Por esta razón los epidemiólogos se concentraron en buscar a los microbios en el medio ambiente, y encontraron principalmente dos conclusiones, la primera es que las enfermedades de la infancia no los proteja contra dichos padecimientos, y la segunda, los organismos que aparecieron relevaste para la hipótesis de la higiene son los que coevolucionaron con los humanos.

Por otra parte en el texto se nos hace referencia a que la microbiota gastrointestinal también tiene un control parcial sobre la inmunoregulación del huésped, y además que un animal libre de gérmenes tiene un sistema inmunológico poco desarrollado.

El artículo es interesante, porque no muestra que la higiene no es garantía de no quedar enfermos, si no que hay enfermedades que afectan en mayor medida a los lugares así, aún cuando las condiciones sean idénticas.

Quintero Ortiz Ariel Elimelec

The Impact of Differential Regulation on Bacterial Speciation

Eduardo A. Groisman

Las bacterias son la forma de vida más abundante en la tierra, juntas forman  una familia biológica, pero como en todas las familias, sus miembros muestran preferencias distintas para diversos factores, como el alimento y la  tolerancia de su temperatura. Tomemos como ejemplo a nuestra familia, todos tenemos un parentesco, pero esto no es motivo de que en general los integrantes gusten de las mismas cosas.

Tomando en cuenta el ejemplo, nos preguntamos ¿si existe una base en los comportamientos, que da fruto a la diversidad estilo y conducta?

La familia Enterobacteriaceae se compone de bacterias que son conocidas gracias a las enfermedades que producen en humanos y animales; sin embargo también existen aquellas especies que no causan malestares. Entonces, ¿Cómo distinguimos entre una especie patógena de una inofensiva?

Howard Ochman propuso cuatro ambientes genéticos para examinar las diferencias existentes entre entre la Salmonela Enterica  y E. coli, bacterias que muestran tener cierto parentesco.

Sus puntos eran: la Salmonela Enterica debe poseer genes virulentos que la E. coli no posee, y viceversa. Ambos genomas se separan por transferencia horizontal de genes, en donde un organismo adquiere un segmento de ADN de otro organismo. Finalmente se tenían que hallar qué productos metabolizan y como lo hacen.

De esta manera se obtienen las diferencias fenotípicas que separan  a la Salmonela de la E. Coli, considerando que sostienen un tipo de parentesco.

Fernanda Jacqueline Jasso Cerón

Oceans of Crenarchaeota: a Personal History Describing This Paradigm Shift

Jed A. Fuhrman

Tratando de ordenar la biodiversidad del planeta, el hombre a través de la historia ah construido grandes conjuntos de especies basándose en una característica en común según sea el caso, de manera que todos los seres vivos están separados y distribuidos en reinos biológicos.

En 1990  Carl Woese propone tres dominios de la vida: Bacterias, Archeas y Eucariontes, dividiendo las segundas en dos grupos Crenarchaeora y Euryarchaeota.

En un principio se creía que las bacterias de este reino eran microorganismos que vivían en condiciones extremas, sin embargo, investigaciones revelaron que la Archea es abundante en la mayoría de los hábitats naturales, especialmente en los océanos.

En 1992 se reporta el descubrimiento de grupos marinos de arqueas (Crenarchaeota), que son extremadamente abundantes y son componente importante del metabolismo del océano. Estos datos llevan al cuestionamiento, sobre ¿Por qué son tan abundantes las Archeas?

De acuerdo con Marcel Kuypers de Microbiología Marina, sugiere que los lípidos sintetizan arqueas marinas utilizando bicarbonato o dióxido de carbono como fuente de carbono, lo que implica un fenómeno por el cual las plantas se bastan a sí mismas para nutrirse partiendo de sustancias inorgánicas, en lugar de realizar un proceso de heterotrofía.

Fernanda Jacqueline Jasso Cerón

12.- Microbiomics: The Germ.....- Tania Vargas

Microbiomics: The Germ Theory of Everything

Alan Dove

Life Science Technologies

www.sciencemag.org/products

Por Tania Lucero Vargas Luna

A lo largo de la historia el conocimiento sobre los virus y enfermedades ha evolucionado notablemente, por ejemplo, en el siglo 19 plantearon una teoría, que en aquel momento parecía ridícula, “las enfermedades son causadas por falta de higiene”, la cual causo conmoción pues todos decían que eso era falso, sin embargo,  algunos investigadores comenzaron a trabajar en esta idea y mas tarde nos demostraron a todos que ellos tenían razón pues los gérmenes causan enfermedades.  

Ahora en el siglo 21 algunos biólogos defienden otra teoría, que pareciera que es igual de loca o absurda,  la cual dice que los humanos y otros microorganismos no andan solos, es decir, no son individuales; sino ecosistemas complejos que dependen de millones de microbios; al igual que en el siglo 19 existen investigadores dedicados que tratan de demostrar que esta teoría es cierta, poco a poco sus esfuerzos son retribuidos pues sus resultados son convincentes, es asi como surge la teoría Microbiomic de la vida.

Actualmente la tecnología nos permite estudiar con mayor facilidad a los microorganismos no cultivables para poder secuenciar su ADN.  Implementando también estrategias de muestreo, técnicas de análisis de dados, etc.

Debido a que existen muchas bacterias, hongos, protozoos y viros que no se pueden cultivar en un laboratorio, han emergido nuevas técnicas, utilizando tecnología, para la secuenciación de ADN, consiste  en muestrar su entorno, secuenciando la mayor cantidad de ADN posible, utilizando la información de la secuencia para identificar los organismos y probablemente también sus funciones ecológicas.

Gracias a estos métodos se ha podido analizar el microbioma del hintestino grueso de los humanos, lo cual ha revelado que cada persona tiene una mezcla totalmente única de bacterias; obiamente, si este microbioma es alterado puede causar enfermedades muy graves, he incluso muerte por inanición.

Para clasificar los organismos, normalmente los biólogos pueden tomar un enfoque taxonómico y hacer una lista de las especies presentes, clasificarlos por sus características y por sus nichos o bien pueden centrarse en construcciones de arboles filogenéticos basados en la evolución. Sin embargo  existe un método mas fácil para cuantificar la diversidad, el cual esta basado en tres tipos de diversidad: la alfa (basada en el numero de especies en un área especifica), la diversidad beta (compara la diversidad entre diferentes áreas) y finalmente la gamma (utiliza alfa y beta para tener en cuenta la diversidad total del ecosistema).

En cuanto a Microbiomics médicos, normalmente los investigadores miden la diversidad alfa del microbioma en una sola persona y calculan la beta entre los diferentes microbiomas de diferentes personas

Luego de que los investigadores de microbiomics  se decidieron por su diseño experimental, pasan a la decisión de que tipo de secuenciación harán, la de ARN ribosómico (ARNr) o la de fragmentos aleatorios de genomas enteros.

En la secuenciación de ARNr se utilizan cebadores para amplificar solo los genes ARN ribosómico 165; el numero de diferentes secuencias de este gen nos puede dar una muestra de la cantidad de especies y las bases de datos de estas secuencias pueden ser utilizadas para identificar otros organismos.

Por otro lado en la secuenciación de metagenomic, implica secuenciación de fragmentos cortos al azar de todos los genomas en una muestra y tratar de reconstruirlos juntos.

El desarrollo de maquinas de alto rendimiento capases de secuenciar ADN puede ser un paso muy importante para relativamente facilitar el trabajo de los investigadores. Estas maquinas incluyen software que analizan datos y realizan una especie de control de calidad inicial.

Estos grandes avances en la tecnología ya alcanzaron a la medicina y al desarrollo de medicamentos  lo cual resultara de gran ayuda y optimizan la secuenciación de genes para poder detectar organismos específicos de forma mas rápida y precisa.

Gracias a estas maquinas puede salir una gran cantidad de información sobre los organismos secuenciados, a la cual se le puede dar una gran variedad de usos, la que mas destaca en este articulo es la medicina, podríamos encontrar el gen especifico de muchísimas enfermedades gracias a estas maquinas, y probablemente después tener una cura para cada una de ellas.

Ensayo sobre el articulo “Oceans of Crenarchaeota: a Personal Hystory Describing This Paradigm Shift” por Jed A. Fuhrman.

UNAM-FACULTAD DE CIENCIAS

CARRERA 201-BIOLOGIA 

PRIMER SEMESTRE-BIOLOGIA DE PROCARIONTES 

Roberto Velasco González

Ensayo sobre el articulo “Oceans of Crenarchaeota: a Personal Hystory Describing This Paradigm Shift” por Jed A. Fuhrman.

Es un descubrimiento relativamente joven el de las arqueas, pues fue en 1977 cuando Carl Woese propuso su existencia y un nuevo arreglo de clasificación en dominios, y mas jóvenes son aun todos los descubrimientos relacionados a estos “nuevos” seres.

Las arqueas fueron divididas en dos reinos: el reino Crenarchaeota y el reino Euryarchaeota pero en general todas las arqueas tenían una característica: vivían en lugares extremos, ya sea por temperatura, acides del medio, etc. por lo que uno no esperaría encontrar arqueas en nichos ecológicos “normales” como las aguas de un mar o de un rio, sin embargo se descubrió que si era posible, y no solo era posible, era una realidad y una realidad que presentaba una gran abundancia pues las arqueas podían llegar a representar hasta el 61% de aguas marinas dependiendo de la profundidad.

Esto por si solo fue un gran descubrimiento y muchos lo tomaron como una ridiculez, pero al paso del tiempo y de los estudios este hecho fue comprobado y tuvo que ser aceptado, ahora bien, la sorpresa no acabaría ahí pues pronto se empezó a descubrir la inmensa variedad de metabolismos que estos seres podían presentar.

Primeramente se supuso que eran heterótrofos, pues consumían aminoácidos que se encontraban libre en su medio, sin embargo, pronto se descubrió que podían sintetizar lípidos a base de distintos carbonatos, y no solo eso, se demostró que también eran capaces de metabolizar el nitrógeno.

Esto nos demuestra que en realidad lo que se sabe es poco y que cuanto mas avance la tecnología mas avanzara nuestro conocimiento de los seres vivos, sin embargo, hoy día nos queda aun mucho por delante y mas si se trata de estos seres tan nuevos para nosotros y que cada día nos asombran con alguna novedad de su existir, las arqueas.

Ensayo sobre el articulo “Microbial Origins and Consequences of Dimethyl Sulfide” por Andrew W. B. Johnston, Jonathan D Todd and Andrew R. J. Curson.

UNAM-FACULTAD DE CIENCIAS

CARRERA 201-BIOLOGIA 

PRIMER SEMESTRE-BIOLOGIA DE PROCARIONTES 

Roberto Velasco González

Ensayo sobre el articulo “Microbial Origins and Consequences of Dimethyl Sulfide” por Andrew W. B. Johnston, Jonathan D Todd and Andrew R. J. Curson.

El DMS (dimetil sulfuro) juega un importante papel en la vida marina y no fue sino hasta hace 8 años que su estudio fue iniciado .

Este producto proviene del DMSP que es fabricado por muchas especies de fitoplancton.

El DMSP es un agente importante en los ciclos biogeoquimicos en los que se ven involucrados miles de microorganismos aproximadamente 10000000000 toneladas de este compuesto son producidas al año en el mar. Este compuesto el utilizado por muchos microorganismos y los productos de su metabolismo llegan a ser muy esenciales.

Regresando al DMS este compuesto es una de las principales maneras en que el azufre puede pasar del océano al aire.

Este compuesto también es utilizado como informante químico por muchos microorganismos pues es indicador de comida.

Es importante señalar el peso que tiene el DMSP en la diversidad bacteriana pues muchos distintos organismos bacterianos tiene distintas enzimas que les permiten tratar con el DMSP de distintas formas.

Estudios nos revelan que hay 6 distintos genes que codifican para enzimas que pueden lidiar con el DMSP en distintas formas y estos genes pueden ser encontrados en microorganismos a lo largo de todo el globo terráqueo.

Como podemos ver tanto el DMSP y su derivado el DMS son de vital importancia en el ciclo del azufre y en especial en la vida marina por todas las posibilidades que organismos tanto pluri como unicelulares presentan para beneficiarse de estos dos compuestos y de sus derivados, además de darnos una idea de cómo es que se diversifican los genes y sin embargo, mantiene una función similar.

Ensayo sobre el articulo “Unveling Prochlorococcus” por Sallie W. Chisholm

UNAM-FACULTAD DE CIENCIAS

CARRERA 201-BIOLOGIA 

PRIMER SEMESTRE-BIOLOGIA DE PROCARIONTES 

Roberto Velasco González

Ensayo sobre el articulo “Unveling Prochlorococcus” por Sallie W. Chisholm

La diversidad marina es basta y grande, tanto que aun hoy día seguimos conociendo cosas sobre los seres que conforman esta gran diversidad; esto nos lo demuestra este articulo donde se nos relata sobre el descubrimiento de una nueva especie de fitoplancton.

A veces es difícil imaginar que los arboles y plantas de los continentes nos proporcionen el oxigeno que nos es necesario para vivir; pero mas difícil puede ser el concebir que la mitad de todo el oxigeno proveniente de la fotosíntesis los provean organismos marinos denominados fitoplancton y que una de las especies mas abundantes de este tipo de organismos haya sido descubierta hace solo 25 años.

Veinticinco años es un tiempo muy reciente, entonces cabria el preguntarnos ¿Por qué hasta ahora? Y la respuesta seria sencilla: por que la tecnología no era suficiente.

En todo descubrimiento esta involucrada la tecnología, con mejor tecnología mayores descubrimientos, este fue el caso de Prochlorococcus que empezó a ser descubierto alrededor de 1970 sin embargo fue hasta diez años después que las pocas señales que este organismo daba comenzaron a ser entendidas y por tanto, su existencia empezó a ser concebida en la mente humana.

Y es que Prochlorococcus mide menos de 1 µm de diámetro, por lo tanto las lecturas que indicaban su presencia eran opacadas por las lecturas de otro fitoplancton llamado Synechococcus y normalmente eran interpretadas como errores del lector.

Sin embrago al notar que estas señales incrementaban al tener lecturas a mayor profundidad se dieron cuenta que estas señales no eran errores y que había otro microorganismo habitando el agua.

Ensayo sobre el articulo “Living Machines: Some Assembly Required” por Natalie Kuldell

UNAM-FACULTAD DE CIENCIAS

CARRERA 201-BIOLOGIA 

PRIMER SEMESTRE-BIOLOGIA DE PROCARIONTES 

Roberto Velasco González

Ensayo sobre el articulo “Living Machines: Some Assembly Required” por Natalie Kuldell

Cuando uno estudia una carrera no solo es importante el adquirir conocimiento, lo mas importante es aplicarlo, aplicarlo de manera creativa, sin embargo, esto ultimo no siempre es fácil. Este inconveniente lo sufrían los alumnos del Massachusetts Institute of Technology (MIT) en Cambridge pues el pensar en una idea que fuera del agrado del profesor y poder llevarla acabo aplicando los principios de la ingeniería no siempre era fácil.

Al paso del tiempo esto cambio, y se presenta la “FIRST Robotics Competition” en donde los alumnos de múltiples colegios competían para poder construir determinada maquina con la mayor precisión y efectividad en realizar dicha tarea.

Esta idea fue del agrado de muchos, incluidos los biólogos, que la tomaron este modelo y lo llevaron a su área de trabajo nombrándolo iGEM en donde los estudiantes cambiaron las piezas de metal y madera usadas por los ingenieros por fragmentos “estandarizados” de DNA para lograr un arreglo génico que sea funcional y que agrade e impresione a los jueces.

Claro, el realizar una “maquina biogenética” en base a la ingeniería es un tanto mas “complejo” que el realizar una maquina física en base a la ingeniería. En primera instancia el distinguir los materiales se vuelve algo no tan fácil. Mientras que un ingeniero podría fácilmente distinguir de una polea de las demás piezas que le son otorgadas, el distinguir el segmento indicado de DNA que se necesita en esta competencia supone un mayor reto y no solo eso, el elegir erróneamente seria catastrófico para todo el desarrollo experimental.

Este problema se hace mayor si tenemos en cuenta que cada año el “kit” que se les otorga a los participantes es mayor y muchas de las piezas no son del todo conocidas o estudiadas, por lo que el arreglo génico construido podría no presentar la conducta deseada y el trabajo de todo un verano se iría a la basura.

Otro problema es el saber que tanto puede soportar la célula con la que se trabaja, mientras que un ingeniero podría construir un motor y estar seguro que cierta carrocería seria capaz de soportarlo y trabajar con el; los arreglos génicos que los participantes del iGEM realizan no siempre son soportados por la célula, a veces la llevan a mutar o inclusive a morir.

Ahora bien, todos estos inconvenientes que ciertamente llevan a muchos errores, también llevan al aprendizaje y a la documentación de este, por lo que el iGEM es una herramienta de aprendizaje en todo sentido.

Este conocimiento que se deriva del iGEM ha sido bien manejado y puesto a disposición de muchas personas a través de BioBuilder donde muchos de los hallazgos que se han dado en el iGEM son mostrados y explicados de forma entendible para un gran publico además de verse reforzados con actividades que el mismo sitio web ofrece.

Como podemos ver, algo que inicio como una simple estrategia educativa termino siendo un gran apoyo para la investigación científica, la competitividad y la divulgación. 

Ensayo sobre el artículo “Gut Microbe-Host Metabolic Interactions in Health and Desease.” Por Jia V. y Julian R. Marchesi.

UNAM-FACULTAD DE CIENCIAS

CARRERA 201-BIOLOGIA 

PRIMER SEMESTRE-BIOLOGIA DE PROCARIONTES 

Roberto Velasco González

Ensayo sobre el artículo “Gut Microbe-Host Metabolic Interactions in Health and Desease.” Por Jia V. y Julian R. Marchesi.

Este articulo nos plantea la importancia de la microbiota intestinal que cada uno de nosotros poseemos en nuestro día a día, y como es que estas pueden ayudarnos o bien, perjudicarnos e inclusive, llevarnos a presentar graves padecimientos.

Todos poseemos dentro nuestro una inmensa cantidad de microorganismos dentro de nuestro tracto digestivo, sin embargo, bien se dice que nadie es igual a nadie, y esto aplica también en nuestro tracto digestivo, mas precisamente en nuestro intestino, pues ninguna persona posee los mismos microorganismos y en misma cantidad que ninguna otra persona en todo el mundo.

Ahora bien ¿Esto que tiene que ver con las enfermedades o bien, con la salud? Bueno, es por todos muy bien conocido que muchos de estos microorganismos nos ayudan a tener una mejor absorción de nutrientes y también nos ayudan a combatir intrusos de nuestro sistema digestivo, y esto nos ayuda a poseer una mejor salud. Sin embargo, no muchos saben que también pueden perjudicarnos.

Cada día hay mas estudios que presentan la posibilidad de que nuestros propios hospederos microscópicos nos lleven a padecer de obesidad, de diabetes e inclusive de cáncer.

Por supuesto, estos microorganismos nunca se enteran de esto, ellos solo desean comer, pero su necesidad nos lleva a padecer estas enfermedades.

También se ha estudiado como es que el someterse a un procedimiento quirúrgico en el sistema digestivo como la implantación de una banda restrictiva o bien un bypass gástrico modifican significativamente la microbiota que habita dentro del paciente y por tanto también su calidad de vida, por lo tanto, al hacer uno de estos procedimientos no solo deberá considerarse el cambio en los órganos del paciente, sino también el cambio de su microbiota intestinal y como afectara esto en su recuperación y en su vida posterior a la operación.

Tras esto, es bastante claro que durante muchos años se dejo fuera un aspecto de la salud en cuanto a aspectos gastro-intestinales, un aspecto que ahora se vislumbra como de gran importancia para tratamientos y diagnósticos futuros, no solo somos nosotros, también somos quien nos habita y como estos microscópicos seres nos ayudan o perjudican en nuestra vida.

Ensayo sobre el articulo “Life: is it inevitable or just a fluke?” por N. Lake

UNAM-FACULTAD DE CIENCIAS

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Roberto Velasco González

Ensayo sobre el articulo “Life: is it inevitable or just a fluke?” por N. Lake

El articulo nos plantea la pregunta de que tan probable es que se haya dado la vida en otros lugares fuera de la tierra.

Casi inmediatamente llegamos a la conclusión de que en realidad el hecho de que se genere vida en alguna otra parte del universo es muy probable, pues “iniciar” la vida realmente no requiere de muchas cosas. Siendo esto así, es muy posible que incluso hoy, ya haya seres vivos en otras partes de nuestro universo; entonces ¿Cómo es que nunca nos hemos enterado de su existencia?

Bueno, esto sugiere que tal vez nuestra pregunta inicial este mal planteada, posiblemente una mejor pregunta seria ¿Qué tan probable es el encontrar vida con un cierto grado de desarrollo fuera del paneta tierra?

Esto ya supone algo mucho mas complejo, pues en primer lugar debemos definir lo que nos hace tan “especiales” y nos ha permitido tener una complejidad de organización como la que presentamos hoy día los seres vivos del planeta tierra.

Bueno, es notorio que nuestra organización es mas compleja, somos seres multicelulares y con un gran sistema de regulación y organización, y lo que nos permitió el lograr esta asombrosa hazaña no fue otra cosa si no el tener (en un determinado momento) un excedente de energía. Ahora bien ¿Cómo obtuvimos ese excedente? O mejor aun ¿Qué mecanismo nos permitió obtener energía de forma tan eficiente como para darnos el lujo de tener un excedente?

Bien, esto es debido a nuestras mitocondrias, organelos de doble membrana en donde hay presente un potencial electro-químico que nos permite tener una gran eficiencia en la producción de energía. Sin embargo, debemos ser consientes que esta maravillosa invención de la naturaleza no siempre estuvo ahí; siendo esto así ¿Cómo es que en un principio los seres sin mitocondria obtenían cantidades de energía tan significativas como para tener un “excedente”?

Esta pregunta es resuelta con ayuda de las ventilas hidrotermales pues entre los pequeñas ranuras y fisuras que estas presentan es posible encontrar un pequeño potencial electro-químico que pudo haber servido como una especia de “mitocondria extracelular” en tiempos muy antiguos.

Queda muy claro que la base de nuestro gran desarrollo es el haber podido desarrollar un sistema tan eficiente en producción energética, así pues, la probabilidad de encontrar vida con un nivel de desarrollo semejante a la de la tierra esta íntimamente ligada a la posibilidad de que los organismos que se desarrollen fuera de la tierra presenten un sistema mitocondrial para su producción energética.

Ensayo sobre el articulo “Microbial Syntrophy Ecosystem-Level Biochemical Cooperation.” Por Michael J. Mclnerney, Jessica R. Sieber and Robert P. Gunsalus.

UNAM-FACULTAD DE CIENCIAS

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Roberto Velasco González

Ensayo sobre el articulo “Microbial Syntrophy Ecosystem-Level Biochemical Cooperation.” Por Michael J. Mclnerney, Jessica R. Sieber and Robert P. Gunsalus.

El termino sintropia se uso en primera instancia para referirse al intercambio de compuestos del azufre entre bacterias, sin embargo, este termino pronto se amplio también al intercambio de hidrogeno y otros compuestos en ambientes donde predomina la metanogénesis y donde se ven involucradas las arqueas; el entender este tipo de interacciones entre habitantes en un nicho ecológico es importante para comprender el movimiento de biomasa en los mismos.

Muchas de estas relaciones sintropicas metabolizan alcanos ligeros y aromáticos para darnos compuestos que representan el 70% de las fuentes de petróleo.

Estas relaciones sintropicas también son en parte responsables de degradar polímeros naturales como polisacáridos, proteínas, ácidos nucleícos y lípidos, convirtiéndolos en dióxido de carbono y metano.

Como hemos podido observar, las relaciones sintropicas juegan un importante papel en el ciclo de carbono y en la degradación de compuestos que de otras formas seria difícil el degradar, sin embargo, estas relaciones se basan en un delicado equilibrio y es importante el conservarlo pues el modificar este equilibrio causaría que los compuestos usados en las relaciones sintropicas se acumularan y la liberación de metano fuera menor a la esperada.

Este tipo de relaciones no solo son importantes hoy día, han sido importantes desde tiempos inmemoriales pues gracias a este tipo de interacciones ayudaron al planeta a mantener el calor en tiempos de alguna glaciación.

Poco a poco los mecanismos por los que estas relaciones entre microorganismos se llevan a cabo han ido develándose, sin embargo, aun falta mucho por descubrir no solo en cuanto a los mecanismos que hacen posible estas reacciones, también en cuanto a como afectan el medio ambiente hoy día y las consecuencias que el

modificar estas interacciones podrían tener en problemas ambientales de hoy día ya sea mejorando la situación o empeorándola.

Ensayo sobre el artículo “The Impact of Differential Regulation on Bacterial Speciation” por Eduardo A. Groisman.

UNAM-FACULTAD DE CIENCIAS

CARRERA 201-BIOLOGIA 

PRIMER SEMESTRE-BIOLOGIA DE PROCARIONTES 

Roberto Velasco González

Ensayo sobre el artículo “The Impact of Differential Regulation on Bacterial Speciation” por Eduardo A. Groisman.

Muy apropiada forma tiene de empezar este artículo al ejemplificar como dentro de una misma familia puede haber diferencias en varios rasgos y como esto es observable en las bacterias.

Y es que dentro de una misma familia de bacterias pueden encontrarse individuos con características muy distintas como tolerancias a distintas temperaturas o poder tolerar un determinado pH sin embargo lo mas resaltable bien puede ser el hecho que una bacteria patógena para el ser humano y/o alguna otra especie animal mientras que otra pueda no serlo; ¿a que se debe esto?

Bien, este articulo nos propone cuatro distintas causas para este fenómeno en particular y lo ejemplifica con la ayuda S. entérica y E. coli: 1) Que Salmonella posea ciertos genes que le confieran una virulencia y que E. coli se encuentre carente de ellos. 2) Que E. coli posea genes que supriman su virulencia mientas que Salmonella se vea carente de ellos. 3) Variaciones en las secuencias de aminoácidos que comparten ambas bacterias podrían favorecer el que una de ellas adquiriera un carácter patógeno o bien, prevenir que la otra lo presentara. 4) Podría ver diferencias en las formas en que controlan cuando, donde y en que cantidades producen sustancias que tienen en común.

En particular la 3ra y 4ta razón son las que nos deben de importar mas, en cuanto a un cambio en la secuencia de aminoácidos esta podría representar grandes cambios en especial si se presenta en un factor de transcripción pues esto significaría que bajo cierta señal cierto microorganismo sintetizaría cierta proteína a diferencia de otro microorganismo que tuviera un cambio en su factor de transcripción y no sintetizaría la proteína o bien, la sintetizaría en condiciones distintas.

De tal forma si uno de estos cambios en un factor de transcripción lograra que una proteína para fabricar defensas contra antibióticos se produjera mas

constantemente o en mayor tasa, esto le permitiría a este microorganismo el vivir en un ambiente mas demandante.

También es posible el adquirir los medios para habitar un nuevo ambiente o producir una nueva sustancia por medio de la transferencia horizontal de genes. Estos nuevos genes que bien podrían permitir el habitar y aprovecharse de un dado hospedero también llevan consigo genes para fabricar proteínas regulatorias; esto dado a que es importante el poder regular la cantidad y ocasión en que estas nuevas proteínas se produzcan, y también que no entren en conflicto con las proteínas que ya se producían anteriormente.

Ahora bien, es necesario mencionar que aun estos genes regulatorios nuevos son regulados por otros genes aun mas antiguos, por lo tanto aun en microorganismos distintos se puede encontrar similitudes, en especial en los genes regulatorios.

The Germ Theory of Everything

Microbiomics: The Germ Theory of Everything

 Alan Dove

Es increíble pensar que en el siglo 19 aun no sabían que era lo que causaban las enfermedades, seguían creyendo en mala higiene (pero no sabían por qué) y cuando se dio por primera vez esta propuesta que había microorganismos que las causaban, todos dijeron que era absurda esta idea. Por supuesto investigadores pioneros desarrollaron medios de cultivos estériles, mejores microscopios y otros instrumentos de última generación. Poco a poco la teoría de las enfermedades por gérmenes, se fue haciendo más fuerte.

En el siglo 21, una teoría aún más absurda comenzó a surgir, decía que los humanos están compuestos por varias comunidades de microorganismos, ecosistemas dependientes de miles de millones de microbios. Pero con nuevas estrategias de muestreo, nuevas secuenciación de genes de gran alcance, técnicas de análisis de datos y otras técnicas innovadores, sus resultados fueron convincentes y por extraño que parezca, esto puede ser cierto.

Timothy Harkins dice que los humanos somos un ecosistema caminante, yo pienso que esto es completamente cierto. Sin embargo, los microbiólogos han sabido por mucho tiempo que hay bacterias, protozoarios, hongos, virus, que no pueden ser crecidos en los laboratorios con técnicas de cultivo actuales. Por ello, finalmente la subida de la sensibilidad de tecnologías de secuenciación del ADN, dejara que los científicos estudien mejor estos microorganismos.

Por los tanto, la secuenciación del microbioma y los análisis de resultados siguen siendo más barato. Esto hace que los estudiantes y los científicos puedan estudiar microfauna casi tan  fácil como la fauna. Y muchos científicos, están aplicando este concepto con el ARNr.   

 

Jasso Sanchez Eduardo Arturo

Reinhard E. Matadamas Bárcena

La fijación del nitrógeno

Las bacterias, son uno de los organismos más abundantes en nuestro planeta. Entonces, no es extraño observar que están presentes en muchos procesos que la Tierra lleva a cabo, principalmente siendo el primer productor de los sustratos que los autótrofos aprovecharán para producir azucares. Aunque generalmente no se interprete así, los organismos unicelulares tienen gran importancia biológica para todos los seres vivos, para los seres humanos. Por ejemplo, estos organismos, en relación simbiótica con otros macrorganismos, llevan a cabo ciclos biogeoquímicos de vital importancia. En este caso el ciclo que se analizará es el del nitrógeno.

El ciclo del nitrógeno es muy importante para la vida ya que de él dependen mucho nuestras cadenas alimenticias. A pesar de que el nitrógeno es el elemento más abundante en la atmósfera, las plantas no lo pueden asimilarlo más que como nitrato o amonio por lo que algunas bacterias, se encargan de fijar el nitrógeno en las plantas o el suelo en algunas de estas dos formas. Sin el nitrógeno, las plantas tendrán un déficit proteico, porque es esencial para la formación de aminoácidos y posteriormente proteínas. Las cadenas tróficas se verían seriamente alteradas.

Trichodesmium es una cianobacteria conocida por ser una de las principales bacterias que fijan nitrógeno en el mar.  Dependiendo de los factores fisicoquímicos (una onda de luz con mayor intensidad ó más concentración de fósforo) que necesite, esta bacteria de forma libre puede ser encontrada en muy diversas formas: sola, en colonias o inclusive en un complejo ecosistema; donde interaccionan más especies de cianobacterias y otros microorganismos.

A pesar de que Trichodesmium no necesita de ninguna otra cianobacteria, comúnmente se encuentra en parejas que intercambian productos de nitrógeno, a través de este mecanismo ambas bacterias logran regularse la una a la otra. Estos puntos de unión entre bacterias son muy importantes y puede variar la forma en que se expresan incluso entre la misma especie.

Sin embargo es difícil de determinar y entender a estas bacterias; porque, aunque los procesos no son tan complicados, no pueden ser analizados en laboratorio sino tienen que ser estudiados en su lugar de origen.

Reinhard E. Matadamas Bárcena

Microbios: presentes en todo

Conforme el pasar del tiempo, los seres humanos hemos descubierto nuevo conocimiento que nos permite tener una explicación más aproximada del mundo que nos rodea. De vez en cuando surge un científico valiente, que incluso poniendo su reputación en riesgo, se ha atrevido a enunciar teorías muy revolucionarias para su época y gracias a ellos se han iniciado grandes avances en la ciencia moderna; cuando Louis Pasteur propuso la Teoría germinal de las enfermedades infecciosas, fue muy difícil de creer para muchos y sólo con el pasar del tiempo y tras rigurosas pruebas fue aceptada. Pasteur propicio el inicio de la microbiología.

Actualmente, entre los más reconocidos microbiólogos se gesta la idea de que todos los macrorganismos, plantas, animales, seres humanos, etc. mantenemos una relación simbiótica y en parte somos dependientes de millones de bacterias que habitan a nuestro alrededor; no podemos funcionar aislados.

Sin embargo obtener las pruebas suficientes  y necesarias para que esta teoría sea aceptada es una larga y ardua tarea. Hace no mucho tiempo, los microbiólogos se habían enfrentado al problema de poder identificar y clasificar a los microbios, porque las técnicas de cultivo que se tenían no eran adecuadas y la mayoría de los microbios no pueden ser cultivados en laboratorio. Pero ahora, gracias al vertiginoso avance de la ciencia, se pueden analizar desde su nicho original, facilitando su análisis.

Pero siempre con mayor conocimiento vienen más preguntas. Ahora, ¿Cuál es la dirección que debe tomar la investigación?, ¿Cuál es la mejor manera de estudiar los microbios?. Las comunidades científicas tratan de dar respuesta a estas preguntas, cada quien a su manera. Algunos tratan de establecer especies por taxonomía, otros por filogenética; unos tratan de establecer parentesco con la técnica del 16s ribosomal RNA (el método usado por Woese para determinar los dominios) y otros sugieren que la mejor manera es a través de los metagenómas.

Sin duda pareciera que todas estas técnicas y formas de investigar se contraponen unas con otras, pero no es así. En un campo como lo es la microbiología, donde hay demasiados objetos de estudio y cada vez se requieren herramientas más precisas, donde todavía está en sus inicios, cualquier avance es muy útil y la comprensión (en su mayoría) de toso los microbios que nos rodean es una tarea que requiere del apoyo de todas las comunidades científicas alrededor del mundo.

Reinhard E. Matadamas Bárcena

Microbiología

Todos los seres vivos somos parte de un ecosistema y todos, de manera directa o indirecta, dependen de otros; ninguno puede mantenerse aislado del resto. Como propusieron varios científicos en el inicio de la microbiología, todos los macrorganismos dependen de millones de microrganismos. Estos organismos son de gran importancia para mantener en equilibrio a muchos de los procesos que se llevan a cabo diariamente, ciclos biogeoquímicos, síntesis de sustratos.

Clasificar a todos los microorganismos para facilitar la comprensión de todas las funciones que realizan es una tarea titánica y requiere del apoyo de toda la comunidad científica. Actualmente existe un proyecto a escala mundial llamado “The Earth Microbiome Project”, cuyo principal objetivo es crear una base de datos muy amplia que describa a la mayoría de especies en distintos ecosistemas alrededor del mundo. Estos genomas de los microrganismos pueden ser obtenidos de 2 maneras:

·      A través del estudio de su composición de DNA, la manera en que realiza su metabolismo y sus funciones vitales y la manera en que se relaciona con otros microorganimos

·      De manera inversa, se estudia todo el ecosistema o nicho completo y se identifican los organismos que ahí viven y la manera en que todos conviven

Estas son 2 perspectivas distintas, ambas validas, para obtener un análisis de cierta bacteria en su nicho ecológico. Sin embargo, La investigación microbiana tiene que hacerse con un propósito específico, ya que los microrganismos son tan abundantes en nuestro plantea que sería prácticamente imposible de tener a todos catalogados; sería un esfuerzo enorme, tardado, muy costos y sin resultados inmediatos.

Otro de los principales objetivos de este proyecto tan grande, es el desarrollo de modelos matemáticos que permitan conocer el comportamiento de un ecosistema en un futuro, asi se puede predecir las mejores maneras para preservarlo y evitar su deterioro; por supuesto considerando factores biológicos, físicos y químicos.

En el afán de cumplir con los objetivos principales, se han desarrollado herramientas que facilitan la organización y comparación de la información; por ejemplo se logró estandarizar el método para comparar todos los genomas obtenidos, así todos se pueden observar bajo “la misma lupa”. Además que se ha iniciado también, con una biblioteca para identificar todas las proteínas que los microorganismos pueden producir y lo que cada una hace, algo parecido al Proyecto Proteoma Humano.

Modeling the Earth Microbiome

Jack A. Gilbert and Folker Meyer

El texto comienza diciendo que a nivel mundial el hay mil millones de veces más células microbianas que estrellas en el universo. Esto hace que sea difícil de comprender la complejidad microbiana. Por tanto, los microbios y los ubicuos son importantes para el ecosistema, de hecho científicos hicieron grandes progresos que afirman que las comunidades microbianas interactúan con el mundo de la física, química y biología. Estos progresos tenían dos perspectivas, en uno se podía observar las vías metabólicas que permiten interactuar a las células con el medio ambiente y permiten la producción de más y más células. Y el otro punto de vista se explora la suma de un ecosistema taxonómico y las capacidades funcionales. The Earth Microbiome Project (EMP) es una importante iniciativa que crea múltiples conjuntos de datos comparables que describen a los microorganismos de una amplia variedad de ecosistemas. Esta iniciativa tiene varios proyectos, por lo tanto el EMP depende de interacciones frecuentes entre especialista bioinformáticos y ecólogos microbianos.

Uno de los muchos objetivos es desarrollar modelos matemáticos de ecosistemas. Estos modelos predicen como el cambio de una variable probablemente generara respuestas entre otras variables. Y no solo nos permitirán predecir el cambio de un ecosistema, sino también ayudaran a predecir como los cambios afectaran a la capacidad de un ecosistema para prestar servicios vitales con los que contamos. El EMP también está generando estudios adicionales para ayudar en la validación de las hipótesis acerca de cómo se distribuyen los microorganismos en los ecosistemas.

Sin embargo, carecemos de modelos que utilizan parámetros ambientales para producir las estructuras comunitarias taxonómicas microbianas y tener ese tipo de modelos proporcionaría información valiosa para los parámetros físicos y químicos en los ecosistemas. Afortunadamente Peter Larsen, desarrollo dos enfoques que al combinarse pueden hacer frente a esas necesidades de modelos.

El primer enfoque es el predictive relative metabolic turnover (PRMT) modelo. El segundo microbial assemblage prediction (MAP).

Un buen diseño experimental puede conducir a modelos informativos, que luego se puede utilizar para dirigir el futuro diseño experimental y también para identificar las estrategias de muestreo apropiadas.

Eduardo Arturo Jasso Sanchez

Interactions with Partners Are Key for Oceanic Nitrogen-Fixing Cyanobacteria

Jonathan Francisco Vega Hernández 

Los microorganismos interactúan con otros microorganismos y también con plantas y animales (en el océano los microorganismos son los seres vivos más abundantes) y la fijación de nitrógeno es la base de estas interacciones, en el océano es la

clave para que el ciclo del nitrógeno pueda ser completado. Mucho se ha investigado acerca de los microorganismos que fijan el nitrógeno y las interacciones que llevan a cabo, y con ayuda de secuencias de DNA esto puede ser más facilitado y preciso. Una cianobacteria bien conocida como Trichidesmium, también es el organismo más conocido que lleva a cabo el proceso de la

fijación de nitrógeno y se encuentran en agregados que flotan sobre el mar, aunque se ha comprobado que ellas no necesitan la intervención de sus compañeras para poder vivir bien (los organismos que fijan nitrógeno del grupo A son difíciles de cultivar porque también están vinculadas con el ciclo del carbono y la fotosíntesis). No sólo las cianobacterias son capaces de fija nitrógeno, otros como diferentes grupos simbióticos de cianobacterias y otros tipos también de bacterias son capaces de ello. Los sitios activos de las cianobacterias son los sitios donde se vean a cabo las reacciones y los diatomos son las cosas con las que se relacionan para que existan estas, varían dependiendo la especie, pero los experimentos son muy difíciles. Otros sitios activos son complejos ubicados en la membrana y que son responsables de la transferencia de nitrógeno. Muchos fijadores de nitrógeno son esféricos y fluorescentes por la presencia de clorofila. Las cianobacterias de grupo A soy difíciles de mirar al microscopio o de cultivar, son difíciles de observar porque carecen de los pigmentos que a diferencia de otras cianobacterias las hacen visibles, y el problema de su cultivo se cambió por la

posibilidad de obtenes sus secuencias genomicas; también carecen de rutas metabólicas como la fotosíntesis o la fijación del carbono, además de carecer de otras que son generales de las cianobacterias; lo que hacen ellas es que se asocian con un tipo de algas formadas por fitoplankton para acoplar sus metabolismos. Si estas teorías son ciertas podemos decir que los organismos unen sus metabolismos para que funcionen de una manera eficiente y esto gracias a que los día microorganismos sincronizan sus organelos, y esto dificulta también el proceso de como sucede la fijación, se ha visto que este tipo de cianobacterias llevan a cabo la fijación de carbono (dióxido de carbono); pero llegando a esta investigaciones sólo se han despertado más dudas acerca del como viven estas bacterias y cuales son sus interacciones. La simbiosis ocurren porque las cianobacterias se asocian con otras que tengan un cuerpo largo, un cuerpo largo significa que hay más comida disponible para aprovechar. En conclusión, las metas de las investigaciones acerca de la simbiosis metabólicas pueden tener muchos más descubrimientos y seguramente hay otros metabolismos aún por descubrirse. 

Este articulo me gusto muchísimo porque con el pasa artículo amplio más mi panorama acerca de la microbiología y las investigaciones que se pueden hacer aún, motivándome más a estudiar esta rama.

Lectura 13

Modeling the Earth Microbiome, 2012, Jack A. Gilbert and Folker Meyer, Features, Vol. 7, No. 2, pp. 64-69.

Georgina Corona Rodríguez

Los microbios los encontramos en todos lados sobre la Tierra, son importantes para la función del ecosistema. Durante los últimos 100 años se describen cómo las especies microbianas, consorcios, y las comunidades interactúan con los factores biológicos, físicos y químicos del mundo.

El Proyecto del microbioma Tierra (EMP) es una iniciativa de colaboración para crear múltiples conjuntos de datos comparables de microorganismos que se describen a partir de una amplia gama de ecosistemas; depende de interacciones directas y frecuentes entre bioinformáticos y ecologistas microbianos.

Esta iniciativa tiene varios objetivos, uno de ellos es permitir la comparación de muchos entornos en el planeta, aprovechando los datos que se generan siguiendo protocolos estandarizados, superando así los sesgos, cuando se realiza secuenciación metagenómica, si no se amplifica el ADN, puede traer sesgos en la información. Otro objetivo de la EMP es determinar cómo los sesgos analíticos podrían afectar investigaciones cuando se reconstruyen a partir de los datos secuenciados, comunidades microbianas. También tiene el objetivo de desarrollar una base de datos para el análisis de muestreos, analizando características espaciales de un lugar. También se desea tener un altas mundial de las funciones de proteínas y un catálogo de genomas y sus distribuciones taxonómicas. Por ultimo encontramos que se desea desarrollar y después validar modelos matemáticos predictivos de los ecosistemas. Estos en general proporcionan representaciones abstractas de los ecosistemas. Estos modelos nos ayudarían, además de predecir cómo es un ecosistema, a predecir cómo cambios podrían afectar la capacidad de un ecosistema para aportar sus funciones vitales.

La heterogeneidad del suelo y otras comunidades hace difícil el modelado de las características espaciales de una comunidad microbiana en los ecosistemas. Pero dicha heterogeneidad podría no ser tan irregular. El medio tampoco es estático, pues hay una rotación de sistemas a través del tiempo geológico, dando lugar a distribuciones que se redistribuyen.

El EMP puede ayudar a dilucidar el grado de superposición en la composición taxonómica en diferentes escalas espaciales. Para poder comprender o describir una zona se deben comprender los mecanismos bioquímicos por los cuales las especies en un sistema responden a los cambios de las variables que resultan de cambios físicos o químicos, estos datos pueden ayudar a determinar si existe una comunidad microbiana universal para ecosistemas moderados.

Unveiling Prochlorococcus

Sallie W. Chisholm

Siendo el autor del artículo la persona quien descubrió a este organismo, narra los hechos de sus investigaciones con un entusiasmo que a cualquiera enreda en el encanto del Prochlorococcus.

Prochlorococcus es una pequeña planta unicelular que hace parte importante en la fotosíntesis del planeta, siendo el océano su habitad natural.

El autor maneja la fotosíntesis como parte esencial de la vida, diciendo que “toda la vida proviene de la fotosíntesis”, es natural su expresión después de investigar a la Prochlorococcus hace 27 años, ¿Pero que tiene este organismo que lo hace tan especial?

Quizá sea la manera en que fue descubierta, siendo en primer lugar ignorada y confundida con la Synechococcus.  Ahora sabemos que la mitad de la fotosíntesis en el mundo se hace por el fitoplancton en los océanos y que Prochlorococcus  es el más pequeño y abunde miembro de ese grupo.

En la década de 1970 los avances en la microscopia revelo que los océanos están repletos de células fotosintéticas incluso más pequeñas, alrededor de 1 metro de diámetro y 10 veces más abundantes que el fitoplancton.

 El descubrimiento de Prochlorococcus se dio a través de un laser para estudiar los pigmentos y propiedades de dispersión de la luz de los microbios en el agua de mar, donde se tuvieron señales de la presencia de células color verde, siendo estas señales más evidentes en zonas más profundas, donde las células podrían necesitar más pigmento para cosechar la disminución de la luz del sol, es decir, había presencia de microbios fotosintéticos.

Tras un estudio en laboratorio se obtuvo que dicho organismo contiene clorofila b, un pigmento que se encuentra típicamente en plantas verdes. Pero sin duda la característica más importante es que su estructura tenía un parecido con los cloroplastos

De ser esto verdadero, la incógnita ahora era, si existía una relación entre ambos organismos. La relación entre los organismos podría ser medido mediante la comparación de las secuencias de ADN de genes que son compartidos universalmente a través de todos los seres vivos, de esta manera podríamos saber si el Prochlorococcus comparte un ancestro en común con los cloroplastos de plantas superiores, sin embargo después de las investigaciones se concluyo de que no comparten antepasado en común.

Secuenciando sus genes para desarrollar un árbol genealógico, se demostró que sus cepas podrían agruparse en dos grupos los de alta y de baja iluminación. Las cepas defieren no solo en su temperatura, sino también en su capacidad para utilizar N y P.

Tomando en cuenta que existen 100 millones de células en un litro de agua de mar, y considerando que estas células también contiene clorofila b, se concluye que crecen por día obteniendo la energía del sol y en la noche se dividen en dos, para cada célula que se produce, hay otro que es comido por células pequeñas que deben depender de otros para su alimentación.

Toda esta información se obtuvo al buscar conjuntos de Synechococcus, sin emabrgo, nunca se esperaron los investigadores con encontrarse con un organismo tan impresionante y lleno de interrogantes como lo es Prochlorococcus, esto me lleva a pensar en todos esos caminos que de manera espontanea conduce la Ciencia, siempre estamos en búsqueda de respuestas, pero casi nunca tomamos en cuenta que quizá en la esa búsqueda encontremos otro camino que nos produzca más interrogantes, como en el caso de este organismo al autor.

Fernanda Jacqueline Jasso Cerón

marco antonio guerra ramirez

“Microbiomics: The Germ Theory of Everything”

Alan Dove

Guerra Ramirez Marco Antonio

Como vemos la microbiología, es una rama de la biología muy importante, la microbiología es fundamental para entender a los microorganismos, como funcionan y cuál es su papel principal en este planeta. A su vez ayudado a  entender mas sobre como la tierra se fue formando y parecieron los primeros organismos.

El estudio de la microbiología, también tiene su complejidad ya que para entender bien a cada uno de ellos, es fundamental saber sobre genética, para poder clasificarlos y decir si tienen relación con otros organismos, también es importante para entender su comportamiento y su función.

Ya que muchas de las funciones que ejecutan estos organismos, son base para saber sobre ciertas enfermedades relacionadas, ya que estos organismos suelen tener un impacto en nuestra salud, gracias a estos organismos se ha podido entender mas sobre algunas enfermedades y sobre todo a tratarlas.

Tanto para la biología como a la medicina, es fundamental saber más sobre esto, en la biología vemos su importancia para entender mas sobre los ecosistemas, como están clasificados y su relación que tienen un organismo con otro organismos, sobre todo en el árbol de genealogía, ha sido su mayor importancia; en la medicina es fundamental saber cómo actúan estos organismos en nuestro cuerpo, como sobreviven dentro de nosotros y como desalojarlos.

Como vemos, el impacto de la microbiología es muy grande, no solo en una área de estudio si no en varias aéreas, también vemos la importancia del avance científico, el avance de nuevos conocimientos que se han aportado a lo largo del tiempo, como estos avances han ayudado en muchas cosas, también vemos el trabajo de los científicos, su dedicación para entender los nuevos conocimientos.

Microbial Syntrophy: Ecosystem-Level Biochemical Cooperation

El artículo se basa en la sintropia, término utilizado por primera vez para descubrir el intercambio de los compuestos del S entre las fototróficas y los quimiótrofos.

En lo personal el texto me pareció confuso, y note que los autores dieron altos y bajos en cuanto a la explicación del tema, primero se basaron en un contexto de un artículo científico y de pronto pasaban a la narración de un texto cualquiera. Por lo tanto la información no me fue muy clara.

Sin más detalle, el tema central son los usos de la sintropia que como mencionaron tiene papel importante en la degradación de compuestos aromáticos, proteínas, ácidos nucleídos y lípidos, transformándolos a CO2 y metano, a través de sus derivados CoA, degradandolos a sustratos metanogénicas.

Este es un proceso que consta en tres etapas, donde las bacterias hidrolizan los polímeros en hábitats anaeróbicos y luego fermentan los productos hidroliticos al acetato y ácidos grasos de cadena más larga, alcoholes y compuesto aromáticos. Dando como resultado a dos grupos diferentes de metanógenos, los que utilizan hidrógeno y formiato y otros que convierten acetato, formiato, y el hidrógeno a dióxido de carbono y el metano.

El proceso de tres tapas es básicamente operar de manera eficiente a niveles bajos de hidrogeno

Análisis genómicos proporcionan pistas sobre cómo el S. aciditrophicus produce ATP. 

Una de las características más importantes de la syntropia es la transferencia electrónica inversa, un proceso respiratorio especializado que requiere aporte de energía para impulsar los procesos redox termodinámicamente desfavorables.

Fernanda Jacqueline Jasso Cerón