martes, 24 de septiembre de 2013

13.- Modeling the Earth Microbiome




AILA AVILA JULIA TERESA
Modeling the Earth Microbiome
Jack A. Gilbert and Folker Meyer


La ciencia otra vez como modelo, inteligente nos ha sido de gran utilidad en nuestros días, entender la complejidad de las interacciones microbianas con su entorno, con factores biológicos, físicos y por supuesto incluidos factores químicos, ha sido producto de arduas investigaciones y procesos bastante rudimentarios, pero que a la vez han proporcionado información sumamente interesante, con un impacto social trascendental.

Ahora adentrándonos hacia los pasajes de la vida microbacteriana, el proyecto del microbioma en la tierra (EMP)  es una colaboración con la iniciativa de crear múltiples conjuntos de datos comparables entre los microorganismos y los ecosistemas, cuyo objetivo primordial entre uno de los tantos proyectos es generar la amplificación del 16S (RDNA) y la metagenómica.

Entonces el enfoque de EMP es la comparación de muchos ecosistemas, aprovechando el rico contenido  del material genético. Desarrollando de tal suerte modelos que no solo permiten predecir como un ecosistema se comporta, sino que también ayuda a visualizar los cambios que podrían afectar posteriormente la capacidad de un ecosistema.
 En la vida marina, el desarrollo de modelos matemáticos predictivos depende de la comunidad mundial microbiana, composición y estructura, en los océanos, las corrientes distribuyen la vida de manera específica, que tiene que ver con la lucha constante a condiciones y limitaciones ambientales, tales como alcalinidad, salinidad, temperatura entre otras.

El EMP está generando estudios adicionales para ayudar a la validación de hipótesis acerca de cómo se distribuyen los microorganismos en los ecosistemas. Por otro lado un segundo enfoque yace de predicciones de encaje (MAP), para lo cual utiliza redes bayesianas para definir las relaciones entre los medios físicos, biológicos, químicos en unidades graficas, permite predecir la abundancia relativa de las unidades taxonómicas de los parámetros ambientales. Así mismo la vinculación de MAP para PRMT nos da la oportunidad de explorar los niveles relativos de metabolitos como una función de la estructura de comunidades.  Finalmente en el meollo de este asunto, la diversidad de estrategias de muestreo entre las interacciones reproduce una amplia gama de herramientas en contexto de diseños experimentales.

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