Lectura 13

Modeling the Earth Microbiome, 2012, Jack A. Gilbert and Folker Meyer, Features, Vol. 7, No. 2, pp. 64-69.

Georgina Corona Rodríguez

Los microbios los encontramos en todos lados sobre la Tierra, son importantes para la función del ecosistema. Durante los últimos 100 años se describen cómo las especies microbianas, consorcios, y las comunidades interactúan con los factores biológicos, físicos y químicos del mundo.

El Proyecto del microbioma Tierra (EMP) es una iniciativa de colaboración para crear múltiples conjuntos de datos comparables de microorganismos que se describen a partir de una amplia gama de ecosistemas; depende de interacciones directas y frecuentes entre bioinformáticos y ecologistas microbianos.

Esta iniciativa tiene varios objetivos, uno de ellos es permitir la comparación de muchos entornos en el planeta, aprovechando los datos que se generan siguiendo protocolos estandarizados, superando así los sesgos, cuando se realiza secuenciación metagenómica, si no se amplifica el ADN, puede traer sesgos en la información. Otro objetivo de la EMP es determinar cómo los sesgos analíticos podrían afectar investigaciones cuando se reconstruyen a partir de los datos secuenciados, comunidades microbianas. También tiene el objetivo de desarrollar una base de datos para el análisis de muestreos, analizando características espaciales de un lugar. También se desea tener un altas mundial de las funciones de proteínas y un catálogo de genomas y sus distribuciones taxonómicas. Por ultimo encontramos que se desea desarrollar y después validar modelos matemáticos predictivos de los ecosistemas. Estos en general proporcionan representaciones abstractas de los ecosistemas. Estos modelos nos ayudarían, además de predecir cómo es un ecosistema, a predecir cómo cambios podrían afectar la capacidad de un ecosistema para aportar sus funciones vitales.

La heterogeneidad del suelo y otras comunidades hace difícil el modelado de las características espaciales de una comunidad microbiana en los ecosistemas. Pero dicha heterogeneidad podría no ser tan irregular. El medio tampoco es estático, pues hay una rotación de sistemas a través del tiempo geológico, dando lugar a distribuciones que se redistribuyen.

El EMP puede ayudar a dilucidar el grado de superposición en la composición taxonómica en diferentes escalas espaciales. Para poder comprender o describir una zona se deben comprender los mecanismos bioquímicos por los cuales las especies en un sistema responden a los cambios de las variables que resultan de cambios físicos o químicos, estos datos pueden ayudar a determinar si existe una comunidad microbiana universal para ecosistemas moderados.